Det oplyser lokale myndigheder ifølge nyhedsbureauet AFP.
Oprindeligt havde guvernøren for Nordkivu-provinsen, Carly Nzanzu Kasivita, på Twitter skrevet, at mindst 36 var døde.
Angrebet fandt sted i landsbyen Mukondi, som ligger 30 kilometer syd for en af provinsens største byer Beni.
Gerningsmændene menes at tilhøre De allierede demokratiske styrker – en ugandisk gruppe med tilknytning til Islamisk Stat.
De har ikke taget skylden for angrebet.
Ifølge Mumbere Limbadu Arsene, lederen af en lokal ikkestatslig organisation, er dødstallet på 44, skriver Reuters.
Blandt de dræbte er kvinder, børn og ældre, og flere landsbyboere meldes fortsat savnet.
Området, hvor angrebet fandt sted, har siden 2021 været under militærets kontrol i et forsøg på at skabe orden i det konfliktfyldte område.
Oprørsgruppen M23, der består af etniske tutsier, har siden da taget kontrol med store dele af provinsen.
Tidligere på ugen blev en våbenhvile forhandlet mellem en oprørsgruppe og regeringen, der skulle have begyndt torsdag, aflyst.
Aftalen var ellers blevet rost af blandt andet Frankrigs præsident, Emmanuel Macron, der for nylig var på besøg i landet.
Med den kunne EU ifølge AFP have leveret nødhjælp i form af blandt andet medicin og mad til området.
DR Congo beskylder Rwanda for at yde opbakning til M23.
Det er uafhængige FN-eksperter, USA og andre vestlige stater enige i, men regeringen i Rwanda benægter det.
Konflikten har gjort mere end en halv million mennesker hjemløse.
Nordkivu ligger i den nordøstlige del af landet på grænsen til Uganda og Rwanda.
DR Congo er målt på areal det andenstørste land i Afrika.
/ritzau/
Andre læser også